Мисията и задачите на ACER са определени от
директивите и регламентите, включени в Третия енергиен пакет, и по-специално от
Регламент (ЕО) № 713/2009 за създаване на Агенцията. На ACER са възложени
допълнителни задачи през 2011 г. с Регламент (ЕС) № 1227/2011 относно
интегритета и прозрачността на пазара за търговия на едро с енергия (REMIT),
както и през 2013 г. — с Регламент (ЕС) № 347/2013 относно указания
за трансевропейската енергийна инфраструктура.
Общата мисия на Агенцията, както е посочено в
нейния учредителен регламент, е да допълва и координира работата на
националните енергийни регулатори на равнище ЕС, както и да работи за
завършване на единния европейски пазар на електроенергия и природен газ.
ACER изпълнява централна роля в разработването
на обхващаща целия ЕС мрежа и пазарни правила с цел насърчаване на
конкуренцията. Агенцията координира
регионални и междурегионални инициативи, които способстват за интегрирането на
пазара. Тя наблюдава работата на Европейските мрежи на операторите на преносни
системи (ENTSO) и по-конкретно техните планове за разработване на обхващаща
целия ЕС мрежа. И накрая, ACER наблюдава функционирането на пазарите на
природен газ и електроенергия като цяло и по-специално търговията на едро с
енергия.